Untersuchung der Informativität neuer Mikrosatellitenloci beim Kamel

Evdotchenko, Dmitri

Untersuchung der Informativität neuer Mikrosatellitenloci beim Kamel

dc.contributor.advisor	Geldermann, Hermann	de
dc.contributor.author	Evdotchenko, Dmitri	de
dc.date.accepted	2001-12-20
dc.date.accessioned	2024-04-08T08:35:45Z
dc.date.available	2024-04-08T08:35:45Z
dc.date.created	2002-01-16
dc.date.issued	2001
dc.description.abstract	The goal of the investigations was it to use new primers for the representation of polymorphic microsatellite loci in different camel species and to examine new microsatellite loci for Informativity. Some polymorphic loci should be used for the investigation of the genetic differentiation of different dromedary races from Kenya and a bactrian race from Sibiria. For the investigations samples from two species of the old world camels (Camelus bactrianus and Camelus dromedarius) and two species of the new world camels (Llama pacos and Llama glama) were available. As DNA source full blood or leukocyte was used. The representation of the microsatellite loci was carried out with the help of the PCR and following fragment length analysis by means of an automated DNA-Sequencer (A.L.F.). The number of the alleles, their fragment lengths as well as the frequencies of allels and genotypes were computed per locus and taken as original data for estimation of invormativeness. Primer pairs for 34 sequenced loci were tested. 25 of this loci showed specific PCR amplifications with bactrian and dromedary and were therefore included into the further investigations. For instance one third of the loci were found as monomorph, the remaining loci were polymorph. 9 from 17 polymorphic loci showed more than ten alleles in all examined species. The genetic distances between the examined species, computed by means of new microsatellite loci, refer to clear differences between old and new world camels. With the investigations of some dromedary races from Kenya it was shown that the genetic distances estimated on the basis the new marker loci correlated with geographical distances between the races. The investigations supplied thus new informative markers for different genetic analysis in camel. The markers could be also important for the camel breeding (e.g. parentage testing).	en
dc.description.abstract	Ziel der vorliegenden Untersuchungen war es, neue Primer für die Darstellung polymorpher Mikrosatellitenloci in verschiedenen Kamel-Spezies einzusetzen und neue Mikrosatellitenloci auf Informativität zu prüfen. Einige polymorphe Loci sollten beispielhaft für die Untersuchung der genetischen Unterscheidbarkeit verschiedener Dromedarrassen Kenias und einer Trampeltierrasse Sibiriens verwendet werden. Für die Untersuchungen stand Probenmaterial von zwei Spezies der Altwelt-Kameliden (Camelus bactrianus und Camelus dromedarius) und zwei Spezies der Neuwelt-Kameliden (Llama pacos und Llama glama) zu Verfügung. Als DNA-Quelle wurde Vollblut oder aus dem Blut gewonnene Leukozytenfraktion verwendet. Die Darstellung der Mikrosatellitenloci erfolgte mit Hilfe der PCR und nachfolgender Fragmentlängenanalyse im DNA-Sequenzierautomaten. Die Zahl der Allele, ihre Fragmentlängen sowie die Allel- und Genotypfrequenzen wurden pro Locus berechnet und als Ausgangsdaten für Informativitätsberechnungen genommen. Als Parameter der Informativität wurden Heterozygotiegrade, PIC-Index, effektive Anzahl der Allele und Ausschlusswahrscheinlichkeit für einen Markerlocus bzw. für mehrere Markerloci bei der Abstammungskontrolle berücksichtigt. Es wurden Primerpaare für 34 neu beim Trampeltier sequenzierte Loci getestet. 25 dieser Loci zeigten bei Trampeltier und Dromedar spezifische PCR-Amplifikationen und wurden deswegen in die weiteren Untersuchungen der Informativität einbezogen. Etwa ein Drittel der Loci erwies sich als monomorph, die übrigen Loci waren polymorph. Von den 17 polymorphen Loci wiesen neun mehr als zehn Allele auf, ermittelt über alle untersuchten Spezies. Elf Loci zeigten bei Trampeltier und Dromedar Heterozygotiegrade > 0,5. Aus den Ausschlusswahrscheinlichkeiten bei der Abstammungskontrolle ließ sich erkennen, dass ein aussagefähiges Markersystem für Elternschaftskontrollen beim Kamel etabliert werden konnte.	de
dc.identifier.swb	096862696
dc.identifier.uri	https://hohpublica.uni-hohenheim.de/handle/123456789/4947
dc.identifier.urn	urn:nbn:de:bsz:100-opus-167
dc.language.iso	ger
dc.rights.license	publ-ohne-pod	en
dc.rights.license	publ-ohne-pod	de
dc.rights.uri	http://opus.uni-hohenheim.de/doku/lic_ubh.php
dc.subject	Microsatellites	en
dc.subject	Repeats	en
dc.subject	Camelidae	en
dc.subject	Genetic distance	en
dc.subject	Mikrosatelliten	de
dc.subject	Informativität	de
dc.subject.ddc	630
dc.subject.gnd	Polymorphismus	de
dc.subject.gnd	Variabilität	de
dc.subject.gnd	Marker	de
dc.subject.gnd	Kamel	de
dc.title	Untersuchung der Informativität neuer Mikrosatellitenloci beim Kamel	de
dc.title.translated	An Investigation of Informativeness of new microsatellite loci in Camel	de
dc.type.dcmi	Text	de
dc.type.dini	DoctoralThesis	de
local.bibliographicCitation.publisherPlace	Universität Hohenheim	de
local.export.bibtex	@phdthesis{Evdotchenko2001, url = {https://hohpublica.uni-hohenheim.de/handle/123456789/4947}, author = {Evdotchenko, Dmitri}, title = {Untersuchung der Informativität neuer Mikrosatellitenloci beim Kamel}, year = {2001}, school = {Universität Hohenheim}, }
local.export.bibtexAuthor	Evdotchenko, Dmitri
local.export.bibtexKey	Evdotchenko2001
local.export.bibtexType	@phdthesis
local.faculty.number	2	de
local.institute.number	470	de
local.opus.number	16
local.university	Universität Hohenheim	de
local.university.faculty	Faculty of Agricultural Sciences	en
local.university.faculty	Fakultät Agrarwissenschaften	de
local.university.institute	Institute for Animal Husbandry and Animal Breeding	en
local.university.institute	Institut für Tierhaltung und Tierzüchtung	de
thesis.degree.level	thesis.doctoral

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